一、独立实体科研机构

1.  国家单糖化学合成工程技术研究中心

2.  鄱阳湖湿地与流域研究教育部重点实验室

江西省自然灾害监测预警与评估重点实验室

3.  氟硅能源材料与化学教育部重点实验室

4.  国家体育总局水上项目训练监控及干预重点实验室

5.  网络化支撑软件国家国际科技合作基地

6.  先进材料研究院

7.  高等研究院

8.  国家淡水鱼加工技术研发专业中心

9.  苏区振兴研究院

10.  江西经济发展研究院（区域发展研究院）

11.  教育研究院

12.  管理科学与工程研究中心

13.  教师教育高等研究院

二、非独立省部级实体科研机构

1.  江西省光电通信重点实验室

2.  生物多样性保护与资源利用江西省重点实验室

3.  江西省动漫创意与数字娱乐重点实验室

4.  江西省微纳材料与传感器件重点实验室

5.  江西省心理与认知科学重点实验室

6.  中日韩合作研究中心

7.  江西师范大学马达加斯加研究中心

8.  江西高校文科重点研究基地教师教育研究中心

9.  江西高校文科重点研究基地学前教育研究中心

10.  江西师范大学管理决策评价研究中心

11.  江西师范大学心理健康教育研究中心