江西师范大学医院是以解放前中正大学医务所为基础。一九四九年解放后，建立了国立南昌大学医务所，一九五二年全国院系调整，于一九五三年成立了江西师范学院医务所，一九五六年设有观察病床8张。一九七九年将医务所改名为江西师范学院卫生所，一九八四年经南昌市卫生局批准成立了江西师范大学医院，设有普通病床30张，慢性疗养病床20张。2000年由于医院部分房屋拆除，医院无法开设住院部，目前只有门诊观察病床30张。现门诊工作量平均在400-500人次。建筑面积七千余平方米的瑶湖校区新医院正在建设中。
　　医院目前设有：院办公室、瑶湖校区门诊部、青山湖校区门诊部、青云谱校区门诊部、医技科、护理部。医院成立了党支部和部门工会组织。
　　门诊部设内科、外科、妇科、五官科、口腔科、中医科、肠道门诊、注射室、换药室、观察室、挂号收费处，消毒供应室。
　　医技科设预防保健、放射、检验、药剂(中、西药房)、理疗、心电图、脑血流图、b超等科室。
　　校医院现有正式职工44人。其中上任医师1人，副主任医师10人，中级专业技术人员18人，初级专业技术人员10人。
　　在学校党委、行政的领导下，医院全面落实《学校卫生工作条例》，把学校预防、医疗、卫生面向教学、科研。在防病治病，提高卫生质量，改善服务态度，增强师生员工身体健康等方面取得了一定的成绩。曾连续四年在市政府、市总工会、高等学校后勤工作一条龙竞赛中评为先进单位。在市卫生局组织工矿企业、学校医院检查评比中八次被评为先进单位。